Dopo essere stata sede di varie istituzioni militari, dalla seconda metà del secolo XVIII fino al 1970 alcuni degli ambienti della rocca, quelli che anticamente costituivano gli alloggiamenti delle guarnigioni, furono adibiti a prigioni.

Nelle anguste celle, che oggi ospitano piccole esposizioni temporanee, venivano tuttavia confinati solo coloro che dovevano scontare una detenzione non superiore ai sei mesi; per pene superiori era previsto il trasferimento dei condannati nelle carceri italiane.